PivoGraph

做图

如何画带误差棒的柱状图(SD、SEM 或 95% CI)

在 PivoGraph 里画带误差棒的柱状图:把每组数据录入 Column 表的一列,切换到 图表视图,选择 柱形图,再在 设置绘图格式 中选择 均值 + SD、均值 + SEM 或 均值 + 95% CI。柱高和误差棒都由原始数据计算,数据有任何改动,图会随之更新。

柱状散点图:Ifnb1 诱导
示例:柱状散点图:Ifnb1 诱导
在 PivoGraph 中打开示例数据 在浏览器中打开可编辑的副本,数据始终留在你的设备上。

录入数据

  1. 打开 PivoGraph,在左侧 数据表 栏点击 新建数据表。
  2. 表格格式 选择 Column,填写名称后点击 创建。
  3. 在 数据视图 中,每组占一列、每个测量值占一行,并在列标题里写上组名(例如 WT、WT + cGAMP)。

各组的数据个数可以不同,空单元格会被跳过。数据已在表格软件里时,可用 文件 → 数据导入 (CSV) 直接导入。

选择图表类型

  1. 切换到 图表视图。
  2. 在顶部的图表类型中,于 均值/中位数与误差 下选择 柱形图。若要在柱上同时显示每个数据点,改选 个体值 下的 带柱的散点图。

设置误差棒

  1. 点击右侧面板栏中的 绘图,打开 设置绘图格式。
  2. 在 绘图 下拉框中选择:
选项 柱高 误差棒
均值 + SD 均值 ± 标准差
均值 + SEM 均值 ± 均值的标准误
均值 + 95% CI 均值 均值的 95% 置信区间

同一列表中还有中位数 + 四分位距、几何均值等选项。

SD、SEM 还是 95% CI?

SD 反映各个数据点的离散程度;SEM(SD 除以 √n)和 95% CI 反映均值估计得有多精确。无论选哪种,都要在图注中写明,并注明样本量,例如「均值 ± SD,n = 3 次生物学重复」。每组至少有两个数值时才会画出误差棒。计算公式和同一组数据的对比图见标准差(SD)和标准误(SEM)的区别。

导出投稿图片

  1. 在 设置图表格式 和 设置坐标轴格式 中调整字体、线宽和颜色。
  2. 点击右侧面板栏中的 导出,打开 导出图表。
  3. 选择 TIF(矢量图可选 PDF 或 SVG),把 分辨率(DPI) 设为 300 或 600,点击 导出 .tif。投稿图片的格式和分辨率要求见如何导出 300 dpi 的 TIFF 论文配图。

常见问题

怎么在柱上加显著性星号? 对数据表做 t 检验或单因素 ANOVA,再把结果以括号形式放到图上,见如何在图上添加显著性星号。

能画成横向柱状图吗? 可以,在 设置绘图格式 中勾选 翻转 XY。

均值和 SD 用了哪些数据? 每列的全部数值;SD 为样本标准差(n − 1)。这些计算已在验证页与 R 逐值对照。

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