PivoGraph

免费在线绘图

剂量反应曲线在线绘制

剂量反应曲线把反应值(如细胞活力)对浓度作图,并拟合一条 S 形曲线,曲线中点对应的浓度就是 IC50 或 EC50。PivoGraph 对每种处理分别拟合可变斜率的四参数 logistic(4PL)曲线,并把拟合曲线画在数据点上。

开始画剂量反应曲线 在编辑器中打开示例数据,换成自己的数据即可。无需注册,数据始终留在你的设备上。
剂量反应曲线:KRAS-i 类器官存活率(4PL 拟合)
示例:剂量反应曲线:KRAS-i 类器官存活率(4PL 拟合)

需要什么数据

一张 XY 表:X 列每行一个浓度,可以填浓度本身,也可以填它的 log10;每种处理的反应值录成一个数据集。重复 设为每个浓度的复孔数,每个复孔都参与拟合。

拟合给出什么

打开 分析 面板,选择 非线性回归(剂量反应),每个数据集得到:

结果 含义
Bottom、Top 曲线的下平台和上平台
EC50(抑制曲线即 IC50) 反应位于 Bottom 与 Top 正中间时的浓度,单位与数据一致
Hill 斜率 曲线中点处的陡峭程度;反应随剂量下降时为负
R²、Sy.x 曲线与数据点的吻合程度

X 为 log10(浓度) 时选择 log(激动剂) vs. 反应 — 可变斜率,X 为浓度本身时选择 [激动剂] vs. 反应 — 可变斜率。

画在图上

在图上绘制拟合曲线 会把每条曲线画到图上,颜色与所属数据集一致。用 设置坐标轴格式 → 比例 → Log 10 把浓度显示在对数轴上,在 设置图表格式 的 拟合曲线 中修改曲线样式。各处理分别拟合,EC50 可以直接对比。

导出投稿图片

可导出最高 1200 dpi 的 TIFF,或 PDF、EPS、SVG 矢量图,见如何导出 300 dpi 的 TIFF 论文配图。报告 IC50 时带上浓度单位,例如 IC50 = 17.6 nM。

常见问题

IC50 还是 EC50? 同一个参数的两种叫法:促进作用称 EC50,抑制作用称 IC50。

需要几个浓度? 至少 5 个点,并覆盖上下两个平台;浓度最好在对数刻度上均匀分布,例如半对数稀释或 3 倍稀释。